formatieren

Welches Betriebssystem willst du denn auf die Platte installieren?
Ein Windows-System ist von der Installations-CD (-DVD) aus in der Lage, das Einrichten der Partition, das Formatieren und gleich anschließende Installation sicher zu stellen.

Boote den PC von der Installations-CD (-´DVD) aus, starte die Installation und wenn du an der Stelle angekommen bist wo der Bereich festzulegen ist wohin das Windows installiert werden soll - dann löschst du erst einmal alle vorhandenen Partitionen und richtest sie von der Installationsroutine aus neu ein.

Bei diesem Verfahren richtet das aktuell verwendete Windows seinen MBR neu ein und konfiguriert seinen Bootbereich.

War auf der Festplatte schon mal ein anderes Windows als XP installiert und war dabei eine 100 MB große Startpartition erstellt worden - und diese gibt es womöglich noch immer (weil Windows-XP eine Partition ohne LW-Buchstaben nicht verändern konnte).
Das ist eine Überlegung - weil du von "bootmgr.sys" schreibst - eine Datei, die in der 100 MB großen Partition ohne LW-Buchstaben zu finden ist (erstellt von Windows-7).