Diese Überprüfung auszuschalten, ist so ziemlich das Ungünstigste, was Du machen kannst - das geschieht nämlich nur zu Deinem eigenen Schutz und dem Schutz Deiner Daten!
Das aber das System nun einmal ein fehlerhaftes Dateisystem meldet, dann lasse es doch mal richtig reparieren!
Arbeitsplatz > rechter Mausklick auf das Laufwerk > Eigenschaften > Extras > Jetzt Prüfen.
Dort beide Häkchen setzen, ok.
Nun wird Dir der PC vermelden, das dies nicht geht - erst beim nächsten Booten. Du sagst "Ja" und bootest neu.
Jetzt überprüft der PC Dein Laufwerk in 5 Stufen und repariert - das kann durchaus dauern.
Dafür ist allerdings Dein Laufwerk anschließend sauber! Bitteschön - führe dies mit allen Partitionen/Festplatten durch.
Ein Tipp am Ende: chkdsk hat eine Verzögerung von 10 Sekunden für jedes laufwerk eingebaut. Das erscheint mir unnötig und lästig - ich habe es zurückgesetzt.
Machst Du so:
Du kopierst den folgenden Text in den Editor und speicherst das Ganze als "chkdsk.reg" ab.
Windows Registry Editor Version 5.00
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager]
"AutoChkTimeOut"=dword:00000000
Dann ein doppelter Mausklick drauf > in die Registrierung einschreiben > fertig.
Jürgen
PS: Dein Hinweis mit der Neuinstallation ist irrelevant. Dateisysteme können zu jederzeit - sogar während einer Neuinstallation beschädigt werden - auch ohne das gravierende Fehler gemacht wurden. Dann kommt eben eine solche Meldung, um Dir die Chance zu geben, Deine Daten bzw. Deine Installation zu retten!