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Solche Teile sollte man in die Tonne treten
Da werden halt gerne mal Registry-Schlüssel gelöscht die keinen Verweis haben, aber trotzdem noch gebraucht werden, oder Ordner gelöscht, ohne dass das Programm weiß warum der Ordner dort ist und eventuell noch gebraucht wird, oder Registry-Schlüssel verändert obwohl der Nutzer bzw. ein anderes Programm diese ABSICHTLICH geändert hat, etc.
Finger weg!
Wenn man Cookies löschen, Verlauf sicher leeren, unbenötigte Dateireste entfernen will, kann man sich immer "Alle Dateien" anzeigen lassen und mit sorgfalt, gerne auch mal einen Tag lang, alles durchsuchen und per Hand entfernen - in google.de kann man genug Anleitungen finden, welches Programm wo welche Dateien ablegt, also z.B. Cookies usw.
Aber sowohl Datei- als auch Registry-Leichen haben bisher bei all meinen Systemen nur zu marginalen, wenn überhaupt, Leistungseinbußen geführt. Wenn man eine SSD nutzt ist das Cleanup noch sinnloser, weil da kein Lesekopf durch die Gegen bugsiert wird, weshalb man ja auch die Defrag-Dienste deaktivieren muss. Muss weil sonst die Platte endlos daten hin und her verschiebt was der Lebensdauer....
Ach b4 es zu tl;dr wird, in dem Moment, wo das System so verkrüppelt, dass man ein CleanUP durchführen muss, sollte man lieber alles sichern und komplett neu aufsetzen.
Sollte man sowieso alle 2 Jahre, dann verlernt man es auch nicht und eventuell installiert man so auch den ein oder anderen neusten Treiber gleich mit.
EDIT:
Das soll keine negativ-Werbung sein für solche Cleanup-Tools. Ich habe selber vor JAHREN mal versucht, was solche Tools können, und mir dabei gleich beim ersten Mal das System zerschossen. Booten dauerte gleich mal dreifach so lang wie normal, Fehlermeldungen beim Start, usw. - alleine aufgrund dieser Erfahrung rate ich PERSÖNLICH davon ab. Und es gibt ja Tools die direkt davor warnen dass alles was gemacht wird "auf eigene Gefahr geschieht".