Du nutzt Debian. Folge doch einfach dem Tip von Burner. Mit dpkg bzw. dem apt/aptitude Frontend steht dir ein sehr mächtiges Werkzeug zur Verfügung, das die Installation und Pflege von Anwendungen (sogar dem ganzen System) sehr einfach macht.
Du solltest wirklich jede Anwendung über den Befehl
apt-get install <paketname>
installieren
Um den Paketnamen zu bekommen, kannst du mit dem Befehl
apt-cache search <suchbegriff>
nach Gott und der Welt suchen...
Wenn du dann keine Lust mehr auf die Anwendung hast, dann kannst du es (nur das Programm, nicht die Abhänigkeiten) mit dem Befehl
apt-get remove <paketname>
wieder von der Platte löschen.
Falls du bereits eine grafische Oberfläche installiert und konfiguriert hast (sie also läuft), dann kann ich dir das Tool synaptic empfehlen, ein grafisches Frontend für dpkg. Das wird, falls ich mich nicht irre, seit sarge beim Installieren mit aufgespielt. Falls es nicht vorhanden ist:
apt-get install synaptic
Viel Spaß...