Bei deiner Überlegung ist ein Denkfehler enthalten.
Die installierten Programme sind in der Registrierungsdatenbank des Betriebssystem eingetragen.
Nach Neuinstallation des Betriebssystem auf SSD und anschließender Kopplung der HDD mit dem geklonten Ausgangssystem + installierte Programme -> fehlen in der Registrierungsdatenbank der Neuinstalllation die Pfade zu den Programmen, die zu dem Zeitpunkt nur auf der HDD installiert sind.
Du mußt zwangsläufig die Programme in der Neuinstallation auf SSD auch wieder neu installieren.
Wenn du mit einer "Reparaturinstallation" (Inplace-Upgrade) des Systems auf der SSD auch dein Ziel erreichen kannst, dann führe eher solche Reparaturinstallation durch (ohne das Klonen auf HDD).
Aus welchem Grund hast du vor, das System neu zu installieren?