Hat dir diese Antwort geholfen?
Hier, versuche es mit dieser Anleitun.
http://www.ehow.de/stelle-verlorene-emailordner-mozilla-thunderbird-her-wie_11361/
Mehr kann dir auf Grund deiner Angabe "Ich weiß nicht was ich gemacht habe aber auf einmal sind meine angelegten Ordner mit dem Mails verschwunden." nicht angeboten werden.
Wo hast du herumgespielt? In Thunderbird unter Einstellungen? Oder im Windows Explorer?
Total-Commanderhabe ich nicht, kann dir aberkeine Tips zu Inbox geben. Nur komisch, dass sich diese im TC sehen lassen.
Auf deiner Festplattegibt es einen Ordner "Thunderbird".
Du kannst die Suchfunktion benutzen oder selber suchen. Dieser Ordner befindet sich
Dein "User-ame> Anwendungsdaten>Thunderbird>Profiles>Zeichenkette.default.
Hier sollten alle deine Daten vorhanden sein.
Z.B. ImapMail,Mail und so weiter.
Wenn du nicht weiterkommst, die Daten sich in diesem Ordner befinden, dann kopiere den gesamten Ordner auf einen anderen Platz. Dann installierst du Tunderbird neu und ersetzt den neu angelegten Thunderbird Ordner durch den vorherigen Ordner. In den meisten Fällen ist wieder alles OK-
Um solchen Pannen aner vorzubeugen, gibt es ein Tool welches von allen Einstellungen ein Backup macht welches wieder zurückgespielt werden kann.
http://www.chip.de/downloads/MozBackup_13010847.html
Edit: Vergessen zu erwähnen, unter Hilfe hast du eine Option "Informationen zur Fehlerbehebung" könnte dir auch weiterhelfen. Aber deine Accounts sind noch sichtbar? Dann öffne den Reiter "Bearbeiten>Ordner-Eigenschaften " und lasse diese Reparieren.