Wenn der Drucker als WLAN-Client angemeldet ist, dann ist der MFC mit allen Funktionen an der Fritz!Box bekannt und erhält seine IPv4 von da.
Das USB-Kabel kannst du getrost abstecken, wenn das Gerät als Netzwerkclient erkannt ist.
Hast du die Einbindung in's WLAN ablaufen lassen über die WPS-Funktion von Fritz!Box und Brother-MFC ? - Wenn das erfolgreich war, ist doch alles ok und das Gerät wird beim nächsten Einschalten wieder mit der Fritz!Box verbunden.
Welche Schritte willst du denn "von der Fritz!Box aus" am MFC erledigen?
Die Einrichterei machst du doch vom PC aus.
Vermischst du vielleicht das Faxen per Brother-MFC mit der Fax-Funktion, die von der Fritz!Box aus genutzt werden kann?
Das sind eigentlich voneinander unabhängige Funktionen.