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Das Problem bei allen Deinstallationstools ist, dass man nie wirklich sicher sein kann, ob eine fragliche Datei nicht doch von einem anderen Programm noch gebraucht wird. Hat man z.B. zwei verschiedene Programme ein und desselben Herstellers und löscht eines davon mit allen zugehörigen Teilen, so kann es sein, dass dem anderen Programm nun wichtige Dateien fehlen. Das ist unter Windows übrigens nicht anders.
Der Mac reagiert erfahrungsgemäß unkritisch, wenn alte Programmreste auf der Platte verbleiben. Einigermaßen hemmungslos kann man Preferenzen aus den Ordnern Library > Preferences und aus dem Benutzerordner > Library > Preferences löschen. Hier gehen schlimmstenfalls einige Voreinstellungen von Programmen verloren.