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Hm, da ich FileVault nicht verwende, weiß ich das auch nicht genau. Was passiert denn, wenn Du bei der genannnten Meldung auf "Fortfahren" klickst?
Vielleicht kannst Du versuchen FileVault zu deaktivieren. Dann sollten Deine Daten wieder "normal" auf die Platte gespeichert werden (also nicht mehr auf das passwortgeschützte Image). Wenn Du nun FileVault erneut aktivierst müsste eigentlich ein neues (kleineres) Image angelegt werden. Das sind aber alles reine Vermutungen meinerseits.
Du kannst manuell ein passwortgeschütztes Image für Deine brisanten Daten anlegen, indem Du im Festplatten-Dienstprogramm > Neues Image wählst. Gib ihm einen Namen und lege einen Speicherort fest. Unten in dem Fenster kannst Du die Größe des Images festlegen und die Verschlüsselung wählen. Nun kannst Du bei Bedarf das Image per Doppelklick aktivieren. Du gibst Dein Passwort an und das Image erscheint wie eine Festplatte auf dem Schreibtisch. Wirfst Du das Image wieder aus, dann sind Deine Daten darauf vor unbefugten Zugriffen geschützt.
FileVault funktioniert im Prinzip genau so, nur dass alles automatisch - und damit eleganter - funktioniert und Du von dem Image "unter der Oberfläche" praktisch nichts bemerkst. Aber Du kannst eben nur den gesamten Privat-Ordner schützen. Das kostet Zeit und bei einem Passwort-Verlust oder einem Image-Defekt sind alle darauf befindlichen Daten weg.