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Eigentlich sollte das so funktionieren, solange das Template /myGB-templates/default/ existiert.
Habs eben mal selbst getestet mit einer Installation v1.60 und v1.62.
Ich sag aber mal generell: Die Änderungen von der 1er Version auf das Gästebuch v2 wirken sich nicht aus, wenn man die guestbook.php so belässt (bzw. dort direkt die Style-Definitionen drin hat). In v1 sind Code und Design noch nicht getrennt und daher die Wartbarkeit schwieriger und das Aktualisieren damit auch.
In v2 habe ich deswegen Templates eingebaut, wo man nur noch die reinen HTML-Dateien hat, ohne Code. Bis auf den Admin-Bereich wird sich da also nichts ändern.
Es ist natürlich ein Umstand alles zu ändern, aber sollte sich in Zukunft irgendetwas größeres am Code ändern, ist es dann einfacher, das anzupassen (bzw. im Idealfall muss es dann gar nicht angepasst werden, da sich nur am Core etwas ändert und nicht am Template). Du kannst auch ganz normal PHP benutzen und mit include() arbeiten.
Was das Problem mit der Administration verursacht kann ich aber leider nicht sagen. Versuch mal eine unveränderte Installation in einen Testordner hochzuladen.