Kein Zugriff auf die Workgroup

...Ich muss noch dabei erwähnen, hatte starken Virusbefall (Wurm, und Agent)...

Ja ja, das ist so eine Sache.

Ich müsste Backups machen, kennt Ihr ein Backup Programm, möglichst Freeware.

Und die nächste Frage, wenn ich Backup mache von paar Programmen, nehme ich die Fehler mit in die Neuinstallation?

Backup von Programmen geht nicht, da die Einträge in der Registry fehlen würden.

Daten und Einstellungen lassen sich aber in vielen Programmen exportieren. Z.b. beim E-Mail Programmen die E-Mails und Kontoeinstellungen, beim Browser die Favoriten usw.
Eigene Daten und die zu exportierten Einstellungen dann auf externes Medium sichern oder brennen.

Zusätzlich würde es nicht schaden ein Image mit Tool wie True Image (keine Freeware) anzulegen, da man auf dieses Image später im Notfall zugreifen kann, falls Daten vergessen wurden.

Wichtig ist die Sache in Ruhe anzugehen und nicht vorschnell die Formatierung und Neuinstallation durchzuführen